德国足球巴伐利亚区联赛采取双循环赛制（每支球队分别以主、客场身份和其他球队交锋两次）。单场比赛积分计算方法是胜者得3分、负者得0分、平局则双方各得1分，以积分多少排名次序，若积分相同则以得失球比及总入球数等来区别排名。巴伐利亚区联赛的第一名球队获得升级附加赛的资格，而最后2名球队将降入更低级别联赛。