1981年——1986年医学学士河南医科大学卫生系，获医学学士学位。

1991年——1994年医学硕士中国协和医科大学协和公卫学院，获医学硕士学位。

2009.01——2009.10在美国疾病预防控制中心进修传染病监测控制和卫生应急管理。

1986年7月——2002年6月 河南省卫生防疫站流行病科、疾病监测科医师、主管医师、副主任医师；站办公室副主任；计划免疫科主任；副站长。

2002年6月——2003年10月 中国疾病预防控制中心免疫规划中心副主任，副主任医师，长期从事计划免疫、传染病防控、监测和预警等方面工作。

2003年10月——2004年12月 中国疾控中心疾病控制与应急处理办公室副主任，副主任医师

2005年1月——2006年6月 中国疾控中心办公室主任

2006年7月——至今 中国疾控中心疾病控制与应急处理办公室主任

中国疾病预防控制中心主任助理

现任中国疾病预防控制中心副主任、研究员。

他还担任卫生部卫生应急专家咨询委员会委员、疾病控制专家咨询委员会委员，教育部应急专家委员会委员、国家质检总局卫生检疫专家委员会委员、北京市卫生应急专家委员会委员；中国社区卫生协会常务理事、中华医学会公共卫生分会候任主任委员、北京市预防医学会流行病学分会副主任委员及《中华预防医学》、《中国疫苗与免疫》、《现代预防医学》和《中国公共卫生》等杂志编委，国家健康科普专家库第一批成员。

长期从事传染病防控、卫生应急和儿童免疫规划等方面的专业技术和管理工作。承担并完成多项国家和部（省）级及国际组织研究课题和项目。在《新英格兰医学杂志（New England Journal of Medicine）》,《柳叶刀（Lancet）》,《传染病杂志（Journal of Infectious Disease）》、《新发传染病杂志（Emerging Infectious Disease）》、《健康事务（Health Affairs）》、《流行病学（ Epidemiology）》、《中华流行病学信息杂志》、《中华预防医学杂志》等国际、国内学术期刊发表论文80余篇，编（译）专业著作多部，带教硕士研究生30余名。

2020年9月8日，被评为全国抗击新冠肺炎疫情先进个人。

2020年10月，被中央文明办、国家卫生健康委员会表彰为“中国好医生、中国好护士”抗疫特别人物。

2022年4月，上榜“全球顶尖前10万科学家”榜单。

2022年2月2日，北京冬奥会火炬在北京奥林匹克森林公园传递，冯子健担任火炬手。