林德伯格生于密歇根州底特律，是瑞典移民的后代。他在明尼苏达州小瀑布成长。其父查尔斯·奥古斯特·林德伯格是律师，当国会议员时曾反对美国参与第一次世界大战。其母是化学教师。早年林德伯格曾对药物有兴趣。1922年，他离开了机械工程的课程，参加了飞机师和机械师训练，购买了他的私家飞机——Curtiss JN-4 "Jenny"，成为了特技飞行员。1924年，他开始随美国陆军航空军，训练成美国空军飞行员。以第一名毕业后，他成为了空邮飞行师，1920年代在圣路易斯线工作。

1927年5月20日至21日，林德伯格驾其单引擎飞机圣路易斯精神号(机型：莱安NYP-1)，从纽约市飞至巴黎，跨过了大西洋，其间并无着陆，共用了33.5小时。林德伯格更因此获奥特洛奖。

2002年，其孙艾力克·林德伯格重复了一次林德伯格的路线。

林德伯格的妻子是作家安妮·默洛·林德伯格（Anne Morrow Lindbergh），他们在1929年结婚，共有六名子女，其中长子查尔斯·林德伯格三世在1932年新泽西家中被绑架，并遭撕票。最初凶手要求五万美金赎金，后来提高到七万，凶手被认定是一位德国的移民豪夫曼（Bruno Richard Hauptmann），后被处死刑，但许多人相信他只是倒霉的替死鬼。英国侦探小说家阿加莎·克里斯蒂（Agatha Mary Clarissa Christie）据此疑案发挥写成《东方快车谋杀案》（Murder on the Orient Express）。

在欧洲法西斯主义盛行时，林德伯格数次奉美军之命往德国。1938年，赫尔曼·戈林授林德伯格德国荣誉勋章，林德伯格接受，表示了林德伯格和纳粹亲近。林德伯格更拒绝将勋章交还德国，声称这样做是对纳粹首领“不必要的侮辱”。

纳粹德国展开第二次世界大战后，林德伯格得到孤立主义和亲德国政治派系的支持。1941年1月23日，林德伯格在国会前提案建议美国和希特勒建立中立关系。林德伯格亦是美国第一的主要发言人。1941年9月11日在艾奥瓦州迪莫伊的一个集会中，林德伯格批评犹太人背后操纵，要美国加入同盟国。他同时表明他认为美籍犹太人不太爱国。虽然林德伯格不曾将其勋章交还，但当总统富兰克林·罗斯福质问其忠诚时，林德伯格从美国陆军航空团辞职。

可是在1941年的珍珠港事件后，他想回到航空团，却得不到同意。结果他一直以平民顾问协助二战中的美国。美国陆军航空队虽然与他合作，林德伯格以他的经验提供其他飞行员如何进行长距离飞行以及延长飞机的航程，他并且以平民的身分飞行过50次的战斗任务，其中一次还击落过一架日本战机，只是这个纪录当时没有公开。

二战后他生活在康涅狄格州，同时为泛美航空及美国空军的成员。1954年艾森豪威尔升林德伯格为准将。

1953年，他出版自传《圣路易斯精神号》。这本书获得了1954年的普利策奖，这本书更在2004年由SpaceShipOne flight 16P送上太空。

1957年至林德伯格逝世前，一直和比他小24年的德国帽子制造商Brigitte Hesshaimer发展关系，并有三名子女。他们一直将这件事掩盖，甚至其子女也不知其父的真实身份。其女儿Astrid后来发现林德伯格写给Hesshaimer的书信，在Hesshaimer和安妮·林德伯格死后2年的2003年将此事公开。

晚年，林德伯格在夏威夷毛伊岛生活。1974年死于淋巴癌，葬于Palapala Ho'omau教堂。