萨卡帕蒂亚成立于1946年，俱乐部多次更名，在1961年更名为Verhovyna，1982年更名为Zakarpattia。2001年，萨卡帕蒂亚首次出现在乌克兰超级联赛，然而该赛季他们的成绩排在最后，不得不又降回到乌克兰甲级联赛。最近几年该队长期在超级联赛和甲级联赛间徘徊。